AIGO.gui.project
index
/home/dpm/projects/AIGO-0.1.0/AIGO/gui/project.py

projects.py
 
AIGO is a python library for
the Analysis and Inter-comparison of Gene Ontology functional annotations.
see (http://code.google.com/p/aigo).
        
Created by Michael Defoin-Platel on 21/02/2010.
Copyright (c) 2010. All rights reserved.
 
AIGO is free software: you can redistribute it and/or modify
it under the terms of the GNU General Public License as published by
the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
(at your option) any later version.
 
This program is distributed in the hope that it will be useful,
but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
GNU General Public License for more details.
 
You should have received a copy of the GNU General Public License
along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.

 
Classes
       
__builtin__.dict(__builtin__.object)
Project

 
class Project(__builtin__.dict)
    
Method resolution order:
Project
__builtin__.dict
__builtin__.object

Methods defined here:
__init__(self, **args)
addFA(self, FA)
addGO(self, GO)
addRefSet(self, refSet)
applyStat(self, statistics)
getFA(self, name)
getLoadedFA(self)
load(*args, **kwargs)
removeFA(self, name)
save(*args, **kwargs)

Data descriptors defined here:
__dict__
dictionary for instance variables (if defined)
__weakref__
list of weak references to the object (if defined)

Methods inherited from __builtin__.dict:
__cmp__(...)
x.__cmp__(y) <==> cmp(x,y)
__contains__(...)
D.__contains__(k) -> True if D has a key k, else False
__delitem__(...)
x.__delitem__(y) <==> del x[y]
__eq__(...)
x.__eq__(y) <==> x==y
__ge__(...)
x.__ge__(y) <==> x>=y
__getattribute__(...)
x.__getattribute__('name') <==> x.name
__getitem__(...)
x.__getitem__(y) <==> x[y]
__gt__(...)
x.__gt__(y) <==> x>y
__iter__(...)
x.__iter__() <==> iter(x)
__le__(...)
x.__le__(y) <==> x<=y
__len__(...)
x.__len__() <==> len(x)
__lt__(...)
x.__lt__(y) <==> x<y
__ne__(...)
x.__ne__(y) <==> x!=y
__repr__(...)
x.__repr__() <==> repr(x)
__setitem__(...)
x.__setitem__(i, y) <==> x[i]=y
__sizeof__(...)
D.__sizeof__() -> size of D in memory, in bytes
clear(...)
D.clear() -> None.  Remove all items from D.
copy(...)
D.copy() -> a shallow copy of D
get(...)
D.get(k[,d]) -> D[k] if k in D, else d.  d defaults to None.
has_key(...)
D.has_key(k) -> True if D has a key k, else False
items(...)
D.items() -> list of D's (key, value) pairs, as 2-tuples
iteritems(...)
D.iteritems() -> an iterator over the (key, value) items of D
iterkeys(...)
D.iterkeys() -> an iterator over the keys of D
itervalues(...)
D.itervalues() -> an iterator over the values of D
keys(...)
D.keys() -> list of D's keys
pop(...)
D.pop(k[,d]) -> v, remove specified key and return the corresponding value
If key is not found, d is returned if given, otherwise KeyError is raised
popitem(...)
D.popitem() -> (k, v), remove and return some (key, value) pair as a
2-tuple; but raise KeyError if D is empty
setdefault(...)
D.setdefault(k[,d]) -> D.get(k,d), also set D[k]=d if k not in D
update(...)
D.update(E, **F) -> None.  Update D from E and F: for k in E: D[k] = E[k]
(if E has keys else: for (k, v) in E: D[k] = v) then: for k in F: D[k] = F[k]
values(...)
D.values() -> list of D's values

Data and other attributes inherited from __builtin__.dict:
__hash__ = None
__new__ = <built-in method __new__ of type object at 0x45c7e60>
T.__new__(S, ...) -> a new object with type S, a subtype of T
fromkeys = <built-in method fromkeys of type object at 0x9ec6f24>
dict.fromkeys(S[,v]) -> New dict with keys from S and values equal to v.
v defaults to None.

 
Data
        logger = <AIGO.utils.Logger.Logger instance at 0xb750beac>